鲜奶巴氏杀菌机的工作原理是在一定温度范围内，温度越低，细菌繁殖越慢；温度越高，繁殖越快。但温度太高，细菌就会死亡。不同的细菌有不同的最适生长温度和耐热、耐冷能力。巴氏消毒其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭，但经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢。

        鲜奶巴氏杀菌机不断发展的过程中一些技术也在不断进步，加热降温原理有压缩机和水循环两种，相比之下水循环要比压缩机的效率高，且保留了牛奶的原味，逐步替代了压缩机巴氏杀菌机，水循环巴氏杀菌机的类别在市面上有迷你型、简易型、豪华型、柜式、酸奶鲜奶一体机等种类，随着巴氏杀菌工艺的不断发展，巴氏杀菌机的种类也在不断的增加。